Emploi [stage, 5 mois] : TAL

[Offre diffusée le 22 janvier 2014 sur la liste LN]

Analyse temporelle des dossiers électronique patient

Mots-clés

traitement automatique de la langue, analyse temporelle, domaine biomédical

Durée : 5 mois
Niveau : Master 2 Recherche

Le contenu et l’ambition du stage pourront être modulés en fonction du niveau d’étude et de la durée du stage du candidat.

Résumé

L’objectif de ce stage M2R est d’analyser les dossiers électroniques patient du point de vue chronologique. À partir d’un ensemble de documents contenus dans le dossier d’un patient, ce travail permettra de repérer les événements saillants de l’historique médical du patient ainsi que les marqueurs temporels associés afin de les agréger dans une chronologie synthétique.

Contexte

L’analyse temporelle de textes d’information a pour but général de mieux localiser dans le temps les événements décrits dans ces textes, et donc d’alimenter de façon plus précise des moteurs de recherche ou des outils d’extraction d’information. Pour cela, la première étape est de détecter correctement les expressions temporelles de ces textes. Ces expressions temporelles peuvent être des dates absolues, c’est-à-dire que l’on peut placer sans ambiguïté sur l’axe des temps (par exemple, le 14 janvier 2008), mais aussi des dates relatives, qui nécessitent une phase de résolution ou de normalisation (par exemple, le 14 janvier dernierdans 6 semaines). Dans le cadre du dossier électronique patient, des expressions temporelles propres au domaine de spécialité, le domaine médical, peuvent également être rencontrées (par exemple, à 18 semaines d’aménorrhéeà j+1). Les techniques d’analyse temporelle des textes ont fortement progressé ces dernières années, mais s’attachent en général au domaine journalistique et particulièrement au cadre des dépêches. Nous souhaitons étudier un autre domaine de spécialité, le domaine médical, ainsi qu’un type de document particulier, le dossier électronique patient. Nous nous intéressons à la caractérisation et au repérage automatique des expressions temporelles dans les dossiers électroniques patient afin de déterminer si un traitement spécifique au domaine médical doit être mis en œuvre ou si des outils développés pour un autre domaine sont directement utilisables.

Travail à réaliser :

Selon le niveau d’étude de la personne choisie, nous pourrons nous intéresser à une ou plusieurs des problématiques suivantes :

  • Utilisation et adaptation des outils d’analyse temporelle sur les documents cliniques
  • Réconciliation des expressions temporelles issues de documents différents
  • Création d’une ligne temporelle pour représenter l’historique d’un patient

On utilisera un corpus de plusieurs centaines de documents cliniques de-identifiés en français.

Le stagiaire devra avoir de bonnes compétences en informatique. Des connaissances en traitement automatique de la langue, en terminologie biomédicale et/ou en apprentissage automatique seront un plus.

Durée : 5 mois
Niveau : Master 2 Recherche

Contacts :

Aurelie.Neveol[at]limsi.fr
Xavier.Tannier[at]limsi.fr

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